Se presentan más de 800 obras extraídas de los fondos del museo. Han sido seleccionadas por su significado y su capacidad para traducir los temas en torno a los cuales se desarrolla el discurso histórico.
Estos objetos se caracterizan por su gran diversidad: pinturas, esculturas, planos-relieve, modelos de navíos, mapas y planos, carteles, grabados, fotografías, películas, herramientas, instrumentos científicos, mobiliario, objetos de arte, documentos de archivos, etc.
El museo de historia de Nantes está formado por la agrupación de seis colecciones:
- el museo de Arte decorativo, inaugurado en 1924 en el edificio principal (Grand Logis), cerrado en 1972;
- el museo de Arte popular regional creado por Joseph Stany Gauthier, conservador de 1922 a 1969;
- el museo des Salorges, dedicado a las actividades portuarias, industriales y comerciales de Nantes.
Fundado en 1923 por los hermanos Amieux, fue entregado a la Ciudad de Nantes en 1934.
El edificio que lo albergaba fue destruido por los bombardeos de 1943 y el museo se instaló en el Castillo en los años cincuenta.
- el museo de Nantes por la Imagen, creado en 1927, cerrado en los años 1960;
- el museo colonial del Castillo du Grand Blottereau;
- el museo de Arte religioso instalado en 1933 en "La Psalette" cerca de la Catedral, cerrado en 1969.
Este fondo permanente cuenta con más de 50.000 objetos. Más de 800 están expuestos.
Su análisis científico en los años 1990, por parte del equipo de conservación del Castillo de los duques de Bretaña, permitió destacar la notable predominancia de las piezas de origen nantés de las épocas moderna y contemporánea, relacionadas con las actividades de Nantes y con la evolución de la ciudad en su marco estuarino.